Depende de las condiciones que firmaras con el banco. Pero lo normal es que, tras un proceso judicial, el juez decrete que debes responder con todos tus bienes a la deuda. Por tanto, si con la subasta de una casa no se cubre el importe adeudado de la hipoteca que dejes de pagar, entonces subastarán la otra. Eso es lo normal. De hecho, te pueden embargar hasta tu sueldo.