hola Marine, el sentido común me dice que es mejor la opción de cheques entre bancos para cancelar directamente la hipoteca, pues por muy buena persona que te parezca el vendedor no tienes la certeza absoluta de que tu señal de arras vaya a destinarla a la cancelación.
Al vendedor no le gustará este sistema, pero francamente, con los tiempos que corren no está el tema como para dejar escapar un comprador por meras formalidades.

Saludos y suerte con tu compra.